Laboratoires des cellules souches

L'Hôpital d'Ottawa, Ottawa, Ontario
Domaines d'expertise
  • Séquençage de prochaine génération

    • Séq-ARN
    • Séq petit ARN
    • Séq-ADN
    • Séq-ChIP
    • Analyse de la méthylation
    • Reséquençage ciblé
  • Analyse Affymetrix GeneChip
  • Séquençage d’ADN par la méthode de Sanger
  • Analyse unicellulaire
  • Génotypage
  • Analyse SNP
  •  Amplification multiplex de sonde nucléique dépendant des ligatures (MLPA)
  • Séquençage après traitement au bisulfite
  •  Triage de cellules
  • Cytométrie de flux
  • Réaction en chaine de la polymérase quantitative
Que fait l'installation

Les laboratoires ont deux missions : soutenir les projets de sciences « omique » à haut débit et offrir des technologies de recherche à la communauté scientifique locale. Au cours des 10 dernières années, notre réseau d’utilisateurs s’est considérablement agrandi. Nous offrons maintenant des services à plusieurs centaines de laboratoires individuels surtout en Amérique du Nord, notamment aux laboratoires d’établissements d’enseignement, de gouvernements, d’organisations non gouvernementales et d’entreprises privées. Les laboratoires sont une plateforme de génomique affiliée (http://genomeatlantic.ca/a_notre_sujet_francais/) à l’Institut de génomique de l’Ontario. Notre ambition est de mettre sur pied une infrastructure de recherche stable en repérant des projets d’avant-garde qui posent des défis, qui repoussent les limites des connaissances en biologie et qui auront un impact positif sur la santé humaine. Plusieurs projets de Génome Canada de grande envergure en génomique à haut débit, tels que le Stem Cell Genomics Project, ont été réalisés dans nos installations. Les laboratoires participent aux demandes de subventions visant à amasser des fonds pour des études de génomique à haut débit effectuées grâce aux technologies de pointe de nos installations, et les encouragent fortement. Nous travaillerons à vos côtés, vous fournissant des lettres d’appui et des données de validation de principe. De plus, nous participons aux demandes de subventions collectives, à la demande. Pour en savoir plus, veuillez communiquer avec Pearl Campbell, directrice de StemCore.

Services de recherche

GeneChip d’Affymetrix, Séquençage de l’ADN selon la technique de Sanger, Génotypage, Séquençage de nouvelle génération, Triage de cellules, cytométrie de flux, PCR quantitative

Secteurs d'application
  • Agriculture, alimentaire et sciences animales
  • Éducation
  • Technologies et services de l’environnement
  • Pêches et aquaculture
  • Foresterie et industrie forestière
  • Soins de santé et services sociaux
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
  • Fabrication et transformation

Nom du laboratoire spécialisé

Nom de l’équipement

Résumé de la fonction

Installation de séquençage de la prochaine génération

NeoPrep d’Illumina

Préparation automatisée de bibliothèque, dont ARNm à brin TruSeq et nano ARN TruSeq pour utilisation sur toute plateforme de séquençage Illumina

 

MiniSeq d’Illumina

Plateforme de séquençage à petite échelle de prochaine génération utile pour le séquençage d’amplicon, d’ARN ciblé, de petit ARN, de panneaux de gènes ciblés et de petit génome. Maximum de 25M de lectures par exécution @ 2 x 150 bases

 

MiniSeq Illumina

Plateforme de séquençage à échelle moyenne de prochaine génération utile au reséquençage d’exome, de transcriptome, de ChIP-Seq et ciblé. Maximum de 400M lectures par exécution @2 x 150 bases

 

MX3005p de Stratagene

Instrument de PCR quantitative en temps réel pour la validation orthogonale de données d’expression génique à haut débit et la quantification de bibliothèques de séquençage de prochaine génération

Installation d’analyse unicellulaire

Système d’analyse unicellulaire Fluidigm C1

Isole et prépare des cellules individuelles en vue d’analyses génomiques, dont le séquençage d’ADN, de transcriptome, d’expression génique ciblé et de miARN. Capte, nettoie, teint, lyse, amplifie et récolte l’ADNc de 96 cellules en <13 heures pour l’analyse de l’expression génique

 

Fluidigm Biomark HD

Effectue l’analyse génomique de nanofluides à haut débit de cellules ou de populations en vrac

Installation de microréseaux

Système GeneChip d’Affymetrix

Station d’hybridation, deux stations de fluidique (Fluidics 450) et numériseur GeneChip 7G

 

Analyseur de fragments AATI (Advanced Analytical Technologies)

Évaluation quantitative d’ADN, d’ARN et de protéines

 

Fluorimètre Qubit 3.0 (ThermoFisher Scientific)

Évaluation quantitative d’acides nucléiques et de protéines

Installation de séquençage de l’ADN

Analyseur d’ADN 3730 (Applied Biosystems)

Plateforme de séquençage/génotypage d’ADN par fluorescence à débit moyen basée sur la capillarité

 

Tetrad (MJ Research)

Thermocycleur utilisé pour l’amplification d’acide nucléique ou autres manipulations d’enzymes

Installation de triage des cellules

MoFlo Legacy

Lasers : 355 nm, 405 nm, 488 nm, 561 nm et 640 nm