Plateforme RNomique

Université de Sherbrooke, Sherbrooke, Québec
Domaines d'expertise

La plateforme RNomique de l’Université de Sherbrooke offre un large éventail de services de séquençage de nouvelle génération, de PCR et de bio-informatique à toute la communauté de recherche. Notre plateforme automatisée de calcul et d’expérimentation a été conçue principalement pour du séquençage à grande échelle et des expériences reposant sur la PCR. Les principales applications sont l’étude comparative de l’expression génétique au moyen du séquençage de l’ARN et de la PCR quantitative, ainsi que l’annotation et l’analyse de l’épissage alternatif par PCR en point final couplée à l’électrophorèse microcapillaire (PCR allèle spécifique; ASPCR). De plus, nous préparons, exécutons et analysons sur une base quotidienne quelques milliers d’essais de PCR quantitative et d’ASPCR. Nous offrons aussi des services complémentaires d’isolation et de contrôle de la qualité de l’ARN et de l’ADN provenant de cultures cellulaires et de tissus, ainsi qu’un important soutien en bio-informatique pour les plans d’expérience et l’analyse de données. Les clients peuvent consulter leurs données et leurs résultats expérimentaux sur une application web sécurisée, qui contient d’ailleurs plusieurs modules informatiques permettant d’optimiser l’analyse et la présentation des données. Le personnel de la plateforme met son expertise à la disposition des clients à toute étape de leurs projets. La plateforme est par ailleurs en constante évolution : de nouveaux essais et protocoles bio-informatiques sont créés régulièrement pour répondre aux besoins de la clientèle grandissante.

Que fait l'installation

Détection et quantification de l’ARN et de l’ADN présents dans des échantillons biologiques

Services de recherche

Extraction de l’ARN et de l’ADN, contrôle de la qualité de l’ARN, séquençage de l’ARN, séquençage de nouvelle génération, essais de PCR personnalisés, PCR à haut débit, PCR quantitative, expression génétique, analyse de l’épissage alternatif, bio-informatique, exploration de données de séquences

Secteurs d'application
  • Agriculture, alimentaire et sciences animales
  • Industrie chimique
  • Technologies propres
  • Défense et industrie de la sécurité
  • Énergie (renouvelable et fossile)
  • Technologies et services de l’environnement
  • Pêches et aquaculture
  • Foresterie et industrie forestière
  • Soins de santé et services sociaux
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical

Nom de l’équipement

Résumé de la fonction

Appareil de bioanalyse 2100 d’Agilent

Détection microcapillaire, quantification et contrôle de la qualité de l’ARN et de l’ADN

LC-90 de Caliper

Quantification et détection microcapillaire de l’ADN à grande échelle (trois instruments)

MiSeq d’Illumina

Séquençage de nouvelle génération

PGM (Personal Genome Machine) Ion Torrent

Séquençage de nouvelle génération

GS Junior de Roche

Séquençage de nouvelle génération

CFX384 de Bio-Rad

PCR quantitative avec plaques de 384 puits (trois instruments)

CFX96 de Bio-Rad

PCR quantitative avec plaques de 96 puits (trois instruments)

Applied Biosystems GeneAmp 9700

PCR en point final

Biomek FX

Manipulation de liquides

GeXP Genetic Analysis de Beckman

Électrophorèse capillaire