Recherche en génomique environnementale avec des échantillons d’ADN et d’ARN tissulaires et environnementaux
Traitement d’échantillons d’ADN, d’ARN et de transcriptomes tissulaires ou environnementaux jusqu’à l’analyse, inclusivement.
L’Installation de génomique environnementale est l’un des quatre laboratoires spécialisés opérationnels de l’Institut des Grands Lacs sur la recherche environnementale (GLIER) de l’Université de Windsor.
Quantification et extraction d’ADN (par fluorescence, sur gel, au moyen d’un bioanalyseur, etc.), réaction en chaîne de la polymérase (RCP), RCP quantitative en temps réel (y compris à partir de la teinture SYBR Green et de la technologie TaqMan OpenArray sur mesure), séquençage de nouvelle génération et analyse de fragments.
L’installation peut également effectuer la préparation et l’analyse d’échantillons.
- Technologies et services de l’environnement
- Pêches et aquaculture
- Industrie océanologique
Laboratoires et équipements spécialisés
| Équipement | Fonction |
|---|---|
| Manipulateur de liquides automatisé AccuFill de ThermoFisher | Chargement robotisé de toutes les puces TaqMan OpenArray utilisées pour l’analyse de RCPq en temps réel |
| Bioanalyseur 2100 d’Agilent | Vérification de la quantité et de la qualité des échantillons d’ADN et d’ARN |
| Ion GeneStudio S5 de ThermoFisher | Plateforme de séquençage de nouvelle génération pour effectuer ce type de séquençage |
| Système Ion Torrent Ion Chef de ThermoFisher | Chargement robotisé des puces ioniques utilisées dans le système Ion GeneStudio S5 |
| Lecteur de plaques multimarquante Victor3 V de PerkinElmer | Lecteur de plaques 12 filtres servant surtout à la quantification de l’ADN haut niveau. Pouvant aussi être utilisé pour des essais au moyen de la méthode ELISA ou autres types de méthodes par fluorescence/absorbance. |
| Système de RCP ProFlex –Thermocycleur de ThermoFisher | Exécution de la RCP sur 96 échantillons simultanément au maximum |
| Système de RCP en temps réel QuantStudio 12K Flex de ThermoFisher | Système de 3 blocs servant à effectuer des RCPq sur des plaques de 96 puits, de 384 puits, ou sur des puces OpenArray. Compatible avec les formules chimiques SYBR Green et TaqMan. |
| SeqStudio de ThermoFisher | Identification d’allèles, de polymorphismes à nucléotide simple (SNP) et de microsatellites à l’aide de produits de marquage de RCP par colorant dans le cadre d’études de génétique des populations |
| Manipulateurs de liquides Freedom Evo 150 de Tecan (2) | Extraction automatisée de l’ADN de 192 échantillons de digestat simultanément au maximum au moyen de divers modes d’extraction de l’ADN |
| Lecteur de plaques Spark de Tecan | Lecteur à plaques pour les essais par fluorescence et absorbance |
Partenaires de recherche des secteurs privé et public
- Ministère des Pêches et des Océans
- Université du Nord de la Colombie-Britannique
- Université de Waterloo
- Hatfield Consultants
- Yellow Island Aquaculture Ltd.
Information additionnelle
| Titre | Hyperlien |
|---|---|
| Changer la donne : lancement de la plus vaste étude de l’ADN des poissons à l’Université de Windsor | https://windsorstar.com/news/local-news/game-changer-largest-dna-survey-of-fish-launched-at-uwindsor |
| Une grosse prise pour un réseau de recherche dédié à la protection du poisson | https://www.uwindsor.ca/dailynews/2019-12-09/research-network-angling-conserve-fish |