Analyse des matières biologiques à l’aide de la spectrométrie de masse; génomique fonctionnelle pour définir les rôles des protéines en biologie; production d’anticorps monoclonaux.
Le centre offre une expertise de renommée mondiale en spectrométrie de masse, protéomique, chromatographie, analyse de données et recherche translationnelle. Le laboratoire dispose de matériel de spectrométrie de masse et d’une infrastructure d’analyse des données à la fine pointe grâce auxquels il offre toute une gamme de services aux chercheurs et chercheuses des secteurs universitaire, gouvernemental et industriel. L’équipe utilise un large éventail de matériaux biologiques provenant de sources humaines, de souris et d’autres mammifères, de microbes et de végétaux. Les applications de ces recherches comprennent la quantification des protéines à l’échelle du protéome et les modifications post-traductionnelles afin d’identifier les protéines et les voies régulées ; l’étude des interactions protéine-protéine ; ainsi que la découverte et la validation de biomarqueurs. L’équipe utilise différentes stratégies de spectrométrie de masse quantitative, dont la quantification sans marquage (acquisition dépendante et indépendante des données), le marquage chimique pour le multiplexage (marquage de masse en tandem ou marquage d’isotopes stables par acides aminés en structure cellulaire), et la spectrométrie de masse ciblée (surveillance des réactions parallèles). L’équipe possède une solide expertise en analyse des ensembles de données omiques et multiomiques, notamment l’utilisation de l’apprentissage automatique et de l’intelligence artificielle. Elle peut offrir du soutien en conception expérimentale et en analyse bio-informatique d’ensembles de données complexes, et aider les organisations à respecter les directives de publication concernant les ensembles de données protéomiques.
Les services fournis se font sur la base du recouvrement des coûts et peuvent prendre la forme d’une stricte prestation de services ou d’une collaboration.
- Solutions complètes dans plusieurs domaines : aide à la conception d’études ; identification des protéines régulées de manière statistiquement significative ; modifications post-traductionnelles ; partenaires d’interaction protéique ; identification de panels de marqueurs potentiels.
- Quantification et identification des protéines et des modifications post-traductionnelles.
- Identification des partenaires d’interaction protéine-protéine.
- Caractérisation des protéines purifiées (pureté, séquence, cartographie des modifications post-traductionnelles).
- Élaboration d’essais pour les panels de protéines.
- Analyse assistée par l’apprentissage automatique d’ensembles de données omiques complexes (protéomiques, multiomiques, transcriptomiques unicellulaires).
- Mesure de panels de protéines à l’aide d’Olink.
- Agriculture, alimentaire et sciences animales
- Arts et industrie culturelle
- Industrie chimique
- Défense et industrie de la sécurité
- Éducation
- Énergie
- Pêches et aquaculture
- Foresterie et industrie forestière
- Soins de santé et services sociaux
- Technologies de l’information et des communications, et médias
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
- Industrie océanologique
Laboratoires et équipements spécialisés
Équipement | Fonction |
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Spectromètre de masse timsTOF Pro2 de Bruker | Couplage de la spectrométrie de mobilité des ions piégés (TIMS) à la spectrométrie de masse à temps de vol (TOF) à haute résolution. Quantifie les protéines et les modifications post-traductionnelles à l’aide de l’acquisition indépendante de données. Traite de 30 à 100 échantillons par jour. |
Spectromètre de masse Thermo Scientific Orbitrap Exploris 480 avec interface de mobilité ionique à ondes asymétriques (FAIMS) | Quantifie les protéines et les modifications post-traductionnelles. Maximise la sensibilité grâce à la surveillance des réactions parallèles. |
Système de purification Thermo Scientific KingFisher Flex | Prépare des échantillons à l’aide d’un traitement automatisé pour les applications à haut débit. |
Système Signature Q100 d’Olink | Système de table pour l’analyse de biomarqueurs protéiques, et offre une protéomique ciblée à haut débit axée sur les anticorps. |
Partenaires de recherche des secteurs privé et public
- Instituts nationaux de santé (NIH)
- Université de Miami
- Université de l'Alberta
- Université d'Adelaide
- Université de la Colombie-Britannique