Explorer l’influence des microbes intestinaux sur les réponses alimentaires chez la patientèle atteinte de maladies inflammatoires de l’intestin (MII) à l’aide d’échantillons cliniques, de modèles in vitro et d’analyses multiomiques, en vue de faire évoluer les traitements de précision.
Le laboratoire Lunken mène des recherches d’avant-garde en nutrition de précision dans le but d’accroître les connaissances sur les maladies inflammatoires de l’intestin et d’améliorer leur traitement. Le laboratoire met en commun la science de pointe du microbiome, les études sur les interactions entre l’alimentation et les microbes et l’élaboration de traitements personnalisés, afin de découvrir comment les bactéries et les champignons intestinaux réagissent à divers composants alimentaires comme les fibres et comment ces réactions peuvent être accentuées par une manipulation ciblée du microbiome. Le laboratoire Lunken se distingue parce qu’il intègre sous un même toit des échantillons cliniques humains, de systèmes modèles à haut débit comme le Mini Bioreactor Array (MBRA), de cultures anaérobies et de technologies multiomiques, ce qui le rend incomparable. L’équipe de recherche convertit des échantillons cliniques courants en ensembles de données à haute résolution, qui alimentent des outils d’apprentissage automatique propres à concevoir des stratégies nutritionnelles individualisées. À la croisée des soins cliniques et de la recherche, le laboratoire Lunken s’impose comme un centre dédié aux avancées en matière de traitements personnalisés des maladies inflammatoires de l’intestin qui sont basés sur l’alimentation, et ce, grâce à des approches novatrices axées sur le microbiome.
- Modélisation in vitro du microbiote intestinal à l’aide d'un système Mini Bioreactor Array (MBRA)
- Culture anaérobie de bactéries et de champignons intestinaux
- Essais de réponse du microbiome à divers composants alimentaires, dont les fibres, réalisés avec des échantillons provenant d’une patientèle atteinte ou non de maladies intestinales inflammatoires (MII)
- Expériences de manipulation microbienne pour évaluer le potentiel thérapeutique
- Traitement d’échantillons cliniques
- Génération de données multiomiques (par exemple, métagénomiques, métabolomiques)
- Profilage du microbiome et interprétation des données
- Conception d’études collaboratives et consultation dans le cadre de projets cliniques, universitaires et translationnels
- Soins de santé et services sociaux
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
| Équipement | Fonction |
|---|---|
| Microscope binoculaire BA310 LED de Motic Microscopes | Microscope à champ clair facilitant l’imagerie cellulaire et microbienne. |
| Laveur de microplaques Thermo Scientific Wellwash Versa 2x8 | Lavage de plaques à 96 puits associé à un faible volume résiduel, assurant un nettoyage fiable des essais (ELISA). |
| Centrifugeuses de Eppendorf | Traitement des échantillons dans des tubes et sur des plaques de différentes tailles. |
| Enceinte de sécurité biologique de classe II, type A/B3 de Nuaire | Confinement sûr des échantillons et du matériel biologique dangereux. |
| Réservoir de stockage cryogénique CyroPro BR-1 de VWR | Stockage et conservation des échantillons biologiques dans de l’azote liquide à des températures cryogéniques. |
| Électroporateur 2510 de Eppendorf | Introduction de l’ADN dans des cellules par impulsions électriques. |
| Congélateur vertical PHCbi de série VIP ECO à température ultra-basse | Stockage ultra-froid des échantillons biologiques. |
| Machine à glace de Hoshizaki | Production de glace aux fins de refroidissement au laboratoire. |
| Stérilisateur à vapeur sous vide de modèle 533LS de Getinge | Stérilisation de l’équipement et des dispositifs par vapeur sous pression. |
| Spectrophotomètre NanoVue Plus de GE Healthcare | Mesure de la teneur en acides nucléiques et en protéines. |
| Source d’alimentation électrique pour électrophorèse PowerPac 200 de Bio-Rad | Alimentation en courant électrique pour l’électrophorèse sur gel. |
| Lyseur de tissus TissueLyser III de Qiagen | Homogénéisation des échantillons de tissus pour l’extraction d’ADN/ARN. |
| Centrifugeuse sous vide Vacufuge Plus de Eppendorf | Concentration des échantillons par centrifugation sous vide. |
| Photomètre pour microplaques de 96 puits Thermo Scientific Multiskan FC | Mesure de l’absorbance dans des essais sur microplaques pour quantifier les biomolécules. |
| Ordinateur portable de modèle Inspiron 15 de Dell lié à un lecteur de codes-barres d’Honeywell et à une imprimante thermique directe DiTi 203ID de GA International | Utilisation d’un logiciel d’acquisition et d’analyse des données, numérisation des codes-barres d’échantillons pour assurer le suivi de la biobanque et impression d’étiquettes, de documents et de rapports. |
| Système de mini-bioréacteur à amplitude (MBRA) (conçu sur mesure) | Études intestinales in vitro contrôlées. |
| Hématimètre CellDrop BF (Brightfield) de DeNovix | Dénombrement cellulaire automatisé avec imagerie en champ clair. |
| Système de purification Thermo Scientific KingFisher Duo Prime | Système automatisé d’extraction d’acides nucléiques. |
| Thermocycleur de PCR en temps réel QuantStudio 3 de Applied Biosystems | Déclenchement d’une PCR (réaction en chaîne par polymérase) en temps réel pour la quantification de l’ADN/ARN. |
| Chambre anaérobie de Coy | Enceinte à atmosphère contrôlée pour la microbiologie anaérobie destinée aux études microbiennes. |
Partenaires de recherche des secteurs privé et public
- Institut de recherche de l’hôpital pour enfants de la Colombie-Britannique
- Centre des maladies inflammatoires de l’intestin de la Colombie-Britannique
Information additionnelle
| Titre | Hyperlien |
|---|---|
| Incidence de l’alimentation sur le microbiome intestinal et répercussions potentielles sur les maladies intestinales inflammatoires | https://doi.org/10.1080/19490976.2024.2399360 |
| Le microbiome intestinal et l’apport en fibres alimentaires sont étroitement liés à la fonction et à la maturation des immunoglobulines (IgG) après la vaccination à ARNm contre le SARS-CoV-2 | https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10715502/ |
| Les prédicteurs associés au microbiome intestinal comme biomarqueurs de la réponse aux traitements avancés des maladies inflammatoires de l’intestin : un examen systématique | https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/19490976.2023.2287073 |
| Une alimentation entérale exclusive riche en prébiotiques contribue à soulager la colite grâce à la modulation du microbiome intestinal et à l’expansion des lymphocytes T anti-inflammatoires dans un modèle murin de colite | https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8453203/ |
| Essai par les utilisateurs atteints de maladies inflammatoires de l’intestin visant à modifier l’application de santé numérique MyHealthyGut | https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10521297/ |
| Utilisation du microbiome intestinal comme biomarqueur de la réponse aux interventions alimentaires dans le traitement des maladies inflammatoires de l’intestin : vers une nutrition de précision | https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002916524000595?via%3Dihub |