Recherche translationnelle intégrée; découverte, validation, essais précliniques et recherche clinique ayant pour objet des cibles et des produits pharmaceutiques.
Le centre est un établissement de recherche sur le cancer de calibre mondial grâce à son équipe de scientifiques et de cliniciens. Le centre – initiative de recherche translationnelle pour l'accélération et le développement des découvertes scientifiques – intègre dans une même organisation les composants critiques de la recherche translationnelle, ce qui facilite la gestion transparente des processus complexes entourant la recherche axée sur la découverte ainsi que le développement préclinique et les essais cliniques des médicaments, en étroite collaboration avec des réseaux de recherche et des essais cliniques nationaux, de même qu’avec l’industrie.
L’initiative tire parti du réseau de recherche translationnelle pour transformer les découvertes en applications cliniques et en produits commercialisables. Une description de chacun de nos volets de recherche figure ci-après.
Le Laboratoire Peter Black est associé au Centre de la prostate de Vancouver.
Pharmacologie préclinique
Identification et caractérisation de médicaments cibles; recherche computationnelle sur les nouveaux médicaments (dépistage virtuel, construction d’une bibliothèque combinatoire, modélisation structure et activité); optimisation des pistes assistée par ordinateur (étude absorption-distribution-métabolisme-excrétion et prédiction de la toxicité, biodisponibilité et optimisation de la sélectivité); développement d’épreuves pour biomarqueurs; études de monothérapies et de thérapies combinées; analyses pharmacodynamiques et sur biomarqueurs de nouveaux médicaments dans le cadre d’essais cliniques sur les humains; laboratoire d’étude des tumeurs sur tissus vivants; évaluation rapide et exhaustive de nouvelles petites molécules et de produits biologiques dans des systèmes de modèles cliniques (essais de cytotoxicité, essais clonogéniques, épreuves sur biomarqueurs et interaction médicament-cible et médicament-hors cible, interactions médicament-médicament, lignées cellulaires tumorales in vitro et in vivo/GC, épreuves en chromatographe liquide avec spectrométrie de masse pour études conformes aux BPL).
Analyse génomique
Services à micropuces Agilent (fournisseur de services certifié) :
Analyse de l’expression des gènes, des exons et des parties non codantes; hybridation génomique comparative à l'aide de micropuces du génome (aCGH); catalogue et conceptions personnalisées disponibles.
Séquençage de nouvelle génération:
Séquenceur Ion Proton de Life Technologies – jusqu’à 80 millions de lectures par séquençage, de 2 x 50 bp à 2 x 300 bp PE; Illumina MiSeq – sélection de 1, 4, 15 ou 25 millions de lectures par séquençage, de 2 x 50 bp à 2 x 300 bp. Applications : séquençage de l’exome; séquençage de l’amplicon, dont gènes d’ARNr 16S; séquençage de capture ciblée; séquençage d’ARN (quantitation); séquençage d’ARN (transcriptome); séquençage de petites molécules d’ARN; séquençage du génome entier microbien et viral, dont métagénomique.
Bioinformatique:
Acquisition, traitement, analyse statistique, intégration et visualisation de données de haute densité sur le génome et le transcriptome issues de modèles expérimentaux simples à complexes, à l’aide d’une plateforme parmi plusieurs; utilisation de logiciels permettant l’intégration et l’analyse transparentes inter-plateformes des données sur l’expression, le génome et le séquençage de nouvelle génération, permettant l’exécution d’études très solides et exhaustives.
Pathologie
Isolation et analyse d’ADN/ARN:
Immunohistochimie – coloration simple et coloration double; évaluation immunohistochimique de biomarqueurs; immunofluorescence in situ ; cytogénétique moléculaire, notamment par hybridation in situ en fluorescence (FISH) et hybridation in situ chromogène (CISH); analyses toxicologiques in situ; analyses de ligature de proximité in situ; histologie, y compris immunohistochimie et construction de microréseaux de tissus (TMA) construction; imagerie cellulaire et moléculaire; service d’entreposage d’images; analyses d’images numériques; analyses de tissus embryonnaires entiers; optimisation de protocoles.
Banque d'échantillons biologiques:
La banque d’échantillons biologiques du Centre de la prostate de Vancouver inclut la plus grande banque des tissus suivants : cellules prostatiques cancéreuses avant et après traitement, dont tumeurs stratifiées selon le risque (faible à élevé) (tumeurs primitives et métastatiques appariées); annotation complètes sur les traitements, réponses, stades et indicateurs de pronostic et biomarqueurs de cancers résistants aux traitements.
Essais cliniques
Coordination des phases I à IV des essais cliniques; études pharmacocinétiques, pharmacodynamiques et de biomarqueurs; essais de validation de principe; protocoles normalisés pour l’exécution d’études sur les adjuvants avant prostatectomie radicale (analyse des tissus après exposition aux médicaments); études sur la sécurité et l'efficacité de monothérapies et de thérapies combinées; études de surveillance à long terme; études sur la qualité de vie et les résultats; élaboration de protocoles d’essais cliniques; préparation de documents réglementaires et éthiques en vue de leur présentation à Santé Canada et aux comités d'évaluation institutionnels; négociation d’ententes et de budgets pour essais cliniques; élaboration de normes d’exploitation propres aux études; collecte, entrée, traitement et analyse des données d’essais cliniques et d’échantillons prélevés sur les patients (expérience des formulaires d'exposé de cas imprimés et électroniques); préparation de rapports d’étude clinique; accès à des réseaux nationaux internationaux à centres multiples pour les essais cliniques sur les tumeurs génito-urinaires.
Laboratoires d’épreuves cliniques:
Développement de biomarqueurs et d’épreuves; épreuves sur les CTC humaines; épreuves ELISA sur le plasma et le sérum humain : simples et multiplex.
- Soins de santé et services sociaux
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
Laboratoire spécialisé |
Équipement |
Fonction |
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Pharmacologie préclinique |
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L’unité complète de pharmacologie et de conception de médicaments du Centre de la prostate – initiative de recherche translationnelle pour l'accélération et le développement des découvertes scientifiques aide les clients à définir de nouveaux candidats-médicaments grâce à des méthodes computationnelles et chimio-informatiques, suivies par des activités d’optimisation des pistes, combinées à une évaluation expérimentale exhaustive des activités pharmacologiques. Nos experts ont une grande expérience des aspects computationnels et expérimentaux de la découverte de médicaments conventionnels et peuvent intégrer leurs services en toute transparence aux autres unités du Centre de la prostate – initiative de recherche translationnelle pour l'accélération et le développement des découvertes scientifiques afin de mettre en place tous les composants essentiels à l’exécution d’une recherche translationnelle ciblée. |
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Système de spectrométrie de masse en phase liquide (LC-MS) Waters, incluant : Système de spectrométrie de masse haute définition SYNAPT avec spectromètre de masse Maldi Quattro Premier
Deux systèmes de chromatographie liquide ultra-haute performance (UPLC) ACQUITY, le premier équipé d’un détecteur de fluorescence et le second, d’un détecteur à barrette de diodes (PDA)
Système de chromatographie liquide à haute performance (HPLC) Alliance
Système de spectrométrie de masse en phase liquide (LC-MS) avec analyseur à scintillation liquide et détecteur à barrette de diodes (PDA)
Logiciels d’analyse et d’utilisation de la plateforme |
Évaluation rapide et exhaustive de petites molécules et de produits biologiques nouveaux. |
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Système ForteBio Octet RED |
Détermination des interactions protéine-protéine; évaluation de paramètres comme l’affinité, la sélectivité et la cinétique des liaisons entre les protéines cibles et les inhibiteurs à petites molécules |
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Xenogen Lumina II |
Imagerie fluorescente et bioluminescente in vivo |
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Xenogen Spectrum |
Imagerie fluorescente et bioluminescente in vivo, avec imagerie 3D |
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ProteinSimple NanoPro 1000 |
Analyse quantitative de protéines sur l’expression et les modifications post- translationnelles d’échantillons de petit volume |
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Système Roche xCELLigence |
Analyseur en temps réel sans marqueur permettant d’effectuer la surveillance continue des changements d’état des cellules, y compris le nombre, la viabilité, la morphologie et la migration des de cellules |
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Cytomètre en flux BD FACS Canto II |
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Lecteur de plaques en fluorescence/luminescence Tecan Infinite 200 |
Évaluation de l’activité dans le cadre d’épreuves au moyen de rapporteurs |
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Lecteur de microplaques multimode Tecan F500 |
Détermination de l’inhibition de composés à petites molécules à l’aide d’épreuves de transcription sur lignées cellulaires; détermination des paramètres de liaison à l’aide des valeurs de polarisation de fluorescence des peptides liées aux protéines |
Laboratoire d’étude des tumeurs sur tissus vivants |
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Le Laboratoire d’étude des tumeurs sur les tissus vivants est une ressource unique et utile qui met en œuvre la croissance d’une grande diversité de tissus cancéreux provenant de patients, y compris les cancers à tumeur de bas et de haut grade. Grâce à ces travaux, les chercheurs peuvent étudier facilement des tissus cancéreux humains in vivo et élaborer une grande variété de lignées tumorales transplantables pouvant servir de modèles pour l’analyse de la croissance et de la progression du cancer et des métastases et de la pharmacosensibilité. |
Laboratoire d’analyse avancée sur le génome |
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Le Laboratoire d’analyse avancée sur le génome est un des principaux services du Centre de la prostate – initiative de recherche translationnelle pour l'accélération et le développement des découvertes scientifiques. Il propose des services d’expertise rapides, économiques et personnalisés à l’aide de systèmes à micropuces, du séquençage et de la bioinformatique dans le cadre de projets de petite et de grande envergure. Au service des universités et du secteur privé, notre personnel hautement qualifié formule des recommandations sur le meilleur usage possible des technologies génomiques et transcriptomiques. Nous proposons aussi des solutions de profilage de tissus fixés au formol et inclus dans la paraffine (FFIP) et une analyse bioinformatique complète en aval à l’aide de systèmes à micropuces et des données de séquençage, personnalisée pour chaque projet. Le laboratoire propose des services à tarifs économiques selon un modèle sans but lucratif à recouvrement des coûts. Grâce à nos collaborations internes et externes courantes, nous pouvons continuer d’améliorer et d’étendre nos capacités de R et D et d’accéder à des matériels et des logiciels de pointe, ce qui est avantageux pour nos clients. |
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Système à micropuces Agilent |
À titre de fournisseur de services certifié, nous offrons des applications à micropuces Agilent. |
Installations de pathologie moléculaire et de génomique appliquée
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Les installations de pathologie moléculaire et de génomique appliquée du Centre de la prostate – initiative de recherche translationnelle pour l'accélération et le développement des découvertes scientifiques sont en mesure d’exécuter rapidement des analyses cliniques à haut rendement. Notre accès unique à des tissus cancéreux humains vivants nous permet d’identifier de nouvelles cibles tumorales, de valider les fonctions et de développer des modèles tumoraux.
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Système de coloration Ventana DISCOVERY XT et Ventana DISCOVERY Ultra |
Systèmes de coloration entièrement automatisés pour immunohistochimie (IHC) et hybridation in situ (IHS). |
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Imageur Vectra 2.0 |
Système d’analyse de lames de microscope à fluorescence multispectrale avec capacités d’imagerie à haut débit. |
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Scanneur de lames numérique Leica SCN400 avec chargeur automatique |
Scanneur à haut débit pour lames complètes et montées et microréseaux de tissus. |
Installations d’imagerie cellulaire et moléculaire |
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Les installations d’imagerie cellulaire et moléculaire proposent des technologies de pointe de numérisation fond clair et laser et de microscopie confocale à disque rotatif en fluorescence pour l’exécution d’études de localisation cellulaire et infracellulaire des molécules et des voies cellulaires essentielles à la croissance et à la survie des cellules cancéreuses de la prostate. Ces systèmes d’imagerie servent à surveiller l’expression cellulaire et l’emplacement des protéines et permettent ainsi d’étudier le rôle de ces facteurs dans la régulation de la croissance des cellules cancéreuses, dans leur survie et dans la différentiation des voies de signalisation. |
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Microscope confocal à laser Zeiss 780 |
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Microscope confocal à disque rotatif Zeiss Axio Observer |
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Banque d'échantillons biologiques |
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Le Centre de la prostate de Vancouver est aussi doté d’une banque de tissus tumoraux contenant plus de 2 000 échantillons de tissus prostatiques cancéreux (congelés frais et inclus dans la paraffine). Cette banque de tissus dispose d’une base de données intégrée administrée par un coordonnateur à temps plein, d’un pathologiste de recherche à temps plein et d’autres employés. |
Essais cliniques |
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Les essais cliniques, partie intégrante du Centre de la prostate – initiative de recherche translationnelle pour l'accélération et le développement des découvertes scientifiques, sont menés en étroite collaboration avec la BC Cancer Agency, des réseaux d’essais cliniques nationaux et internationaux et des partenaires sectoriels. Ces réseaux permettent d’augmenter la participation à nos essais cliniques, alors que la structure du système médical canadien et des centres de traitement centralisés, comme le nôtre, assure un suivi serré des données des patients. Grâce à la combinaison des programmes de recherche génito-urinaire du Centre sur la prostate de Vancouver et de la BC Cancer Agency, les patients qui se soumettent à des essais cliniques peuvent participer à une gamme complète d’études expérimentales. L’année dernière, le Centre de la prostate – initiative de recherche translationnelle pour l'accélération et le développement des découvertes scientifiques a lancé 15 nouveaux essais cliniques. Nos réseaux ont effectué de nombreux essais auprès de groupes coopératifs et financés par l’industrie, notamment des sociétés pharmaceutiques et de biotechnologiques connues. De plus, ce groupe a commandité des demandes d'essai clinique présentées à Santé Canada et a subi avec succès des audits par des organismes de réglementation comme Santé Canada et la FDA des États-Unis. |
Laboratoire d’épreuves cliniques |
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Notre Laboratoire d’épreuves cliniques, qui se spécialise dans le dénombrement des cellules tumorales circulantes (CTC) grâce à la plateforme CellSearch® (Veridex), appuie les essais cliniques. Les cellules tumorales circulantes sont des cellules cancéreuses qui, après s’être détachées de la tumeur principale, circulent dans le système vasculaire. Ce type de cellules joue un rôle important dans la transformation et la métastase cancéreuses, et pourrait avoir un impact clinique significatif dans le diagnostic, le pronostic, le traitement et la surveillance. |
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Système Veridex CellTrack Autoprep et système CellTrack Analyzer II |
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Partenaires de recherche des secteurs privé et public
- Pfizer Inc.
- AstraZeneca Canada
- Takeda Pharmaceutical Company Ltd
- Janssen Inc.
- Novartis Pharmaceuticals Canada In.
- GlaxoSmithKline Inc.
- Aquinox Pharmaceuticals Inc.
- Astellas Pharma Canada Inc.
- DelMar Pharmaceuticals Inc
- D-Wave Systems Inc.
- Essa Pharma Inc.
- GenomeDX Biosciences Inc.
- IBM Canada ltée
- Sitka Biopharma Inc.
- Aranda Pharma Ltd.
- Autodesk Inc.
- Bayer HealthCare Pharmaceuticals Inc.
- CellCentric Ltd
- F. Hoffmann-La Roche ltée
- Ionis Pharmaceuticals Inc.
- Orion Canada Inc.
- Var2 Pharmaceuticals ApS
Information additionnelle
Titre |
Hyperlien |
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Prostate Centre Translational Research Initiative for Accelerated Discovery and Development |
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Pre-Clinical Pharmacology |
http://www.pctriadd.com/pre-clinical-pharmacology/expertise-services |
Living Tumour Laboratory |
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Laboratory for Advanced Genome Analysis |
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Molecular Pathology and Applied Genomics |
http://www.pctriadd.com/molecular-pathology/expertise-services |
Bio-Repository |
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Clinical Trials |
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Clinical Assay Laboratory |