Laboratoires StemCore

L'Hôpital d'Ottawa, Ottawa, Ontario
Que fait l'installation

Soutient les projets de génomique à haut débit, notamment ceux exigeant le séquençage de l’ADN, le séquençage de prochaine génération, l’analyse unicellulaire et le tri cellulaire.

Domaines d'expertise

Les laboratoires ont deux missions : soutenir les projets de sciences « omique » à haut débit et offrir des technologies de recherche à la communauté scientifique locale. Les laboratoires sont une plateforme de génomique affiliée à l’Institut de génomique de l’Ontario où sont privilégiées des valeurs d’excellence dans la recherche, de collaboration, de formation des chercheurs et d’innovation. Notre ambition est de soutenir une infrastructure de recherche stable en repérant des projets d’avant-garde qui posent des défis, qui repoussent les limites des connaissances en biologie et qui auront un impact positif sur la santé humaine. Les laboratoires participent aux demandes de subventions visant à amasser des fonds pour des études de génomique à haut débit effectuées grâce aux technologies de pointe de nos installations (séquençage de l’ADN, séquençage de prochaine génération, analyse unicellulaire et tri cellulaire), et les encouragent fortement. Nous travaillerons à vos côtés, vous fournissant des lettres d’appui et des données de validation de principe. De plus, nous participons aux demandes de subventions collectives, à la demande. 

Services de recherche
  • Séquençage de prochaine génération (Séq-ARN, Séq petit ARN, Séq-ADN, Séq-ChIP, Analyse de la méthylation, Reséquençage ciblé)
  • Séquençage d’ADN par la méthode de Sanger
  • Analyse unicellulaire (10x Genomics, Fluidigm C1)
  • Génotypage
  • Analyse SNP
  • Séquençage après traitement au bisulfite
  • Triage de cellules
  • Cytométrie en flux
Secteurs d'application
  • Agriculture, alimentaire et sciences animales
  • Éducation
  • Technologies et services de l’environnement
  • Pêches et aquaculture
  • Foresterie et industrie forestière
  • Soins de santé et services sociaux
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
  • Fabrication et transformation
Laboratoire spécialiséÉquipementFonction
Installation de séquençage de la prochaine générationSystème de séquençage MiniSeq d’IlluminaPlateforme de séquençage à petite échelle de prochaine génération utile pour le séquençage d’amplicon, d’ARN ciblé, de petit ARN, de panneaux de gènes ciblés et de petit génome. Maximum de 25M de lectures par exécution @ 2 x 150 bases.
 Système de séquençage du génome entier NextSeq 500 d'IlluminaPlateforme de séquençage à échelle moyenne de prochaine génération utile au reséquençage d’exome, de transcriptome, de ChIP-Seq et ciblé. Maximum de 400M lectures par exécution @2 x 150 bases.
 Système de PCR quantitative MX3005p de StratagenePCR quantitative (qPCR)-réaction de polymérisation en chaîne quantitative. Instrument de PCR quantitative en temps réel pour la validation orthogonale de données d’expression génique à haut débit et la quantification de bibliothèques de séquençage de prochaine génération.
Installation d’analyse unicellulaireSystème d’analyse unicellulaire Fluidigm C1Isole et prépare des cellules individuelles en vue d’analyses génomiques, dont le séquençage d’ADN, de transcriptome, d’expression génique ciblé et de miARN. Capte, nettoie, teint, lyse, amplifie et récolte l’ADNc de 96 cellules en <13 heures pour l’analyse de l’expression génique.
 Système de réaction de polymérisation en chaîne Biomark HD de FluidigmEffectue l’analyse génomique de nanofluides à haut débit de cellules ou de populations en vrac.
 Plateforme 10x GenomicsAnalyse unicellulaire pour le transcriptome, l’immunothérapie et d’autres autres applications.
 Analyseur de fragments de AATI Évaluation quantitative d’ADN, d’ARN et de protéines.
 Fluorimètre Qubit 3.0 de ThermoFisher ScientificÉvaluation quantitative d’acides nucléiques et de protéines.
Installation de séquençage de l’ADNAnalyseur d’ADN 3730 de Applied BiosystemsPlateforme de séquençage/génotypage d’ADN par fluorescence à débit moyen basée sur la capillarité.
 Thermocycleur Tetrad de MJ ResearchThermocycleur utilisé pour l’amplification d’acide nucléique ou autres manipulations d’enzymes.
Installation de triage des cellulesTrieur de cellules MoFlo LegacyLasers : 355 nm, 405 nm, 488 nm, 561 nm et 640 nm.

 

Titre Hyperlien
Institut de génomique de l’Ontario https://www.ontariogenomics.ca/resources/