Bio-informatique intégrative, analyse de données massives, exploration de données, apprentissage machine et visualisation de données.
La recherche au laboratoire Jurisica porte sur la bio-informatique intégrative ainsi que sur la représentation, l’analyse et la visualisation de données hautement dimensionnelles à la recherche de signatures pronostiques ou prévisionnelles, la détermination de thérapies d’association cliniquement pertinentes et la modélisation de mécanismes fidèles d’action médicamenteuse et de cascades de signalisation modifiées par la maladie.
Nous avons publié de nombreux articles sur l’exploration de données, la visualisation et l’oncologie informatique dans des revues telles Science, Nature, Nature Medicine, Nature Methods, J Clinical Oncology, dont 623 citations hautement influentes (SemanticScholar). Nous avons été cités plus de 14 389 fois (SCOPUS). Le laboratoire Jurisica figure sur les listes de classement des chercheurs les plus cités de Thomson Reuters de 2014, 2015 et 2016, de même que dans les rapports 2014 et 2015 sur les esprits scientifiques les plus influents du monde. Depuis 2015, il agit également à titre de scientifique en chef au laboratoire de destruction créative de la Rotman School of Management.
Analyses de données évolutives, visualisation, annotation et interprétation de données complexes, exploration de données et apprentissage machine, modélisation de mécanismes fidèles d’action médicamenteuse et de cascades de signalisation modifiées par la maladie, recherche de signatures pronostiques fondée sur l’exploration de données.
- Technologies de l’information et des communications, et médias
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
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Laboratoire spécialisé |
Équipement |
Fonction |
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Centre de découverte des sciences de la vie IBM |
Serveurs, grappes et stockage |
384 cœurs en serveurs pSeries IBM (2X p770, p780, p750, 2x p570, p595), grappe de GPU avec 84 cartes Nvidia K20, grappe de 1344 cœurs Linux et plus de 1,6 Po d’espace disque hiérarchique avec bibliothèque d’archives robotisées LTO4 pour l’archivage prolongé des données. |
Partenaires de recherche des secteurs privé et public
- University of Toronto
- McMaster University
- York University
- Queen’s University
- Université de Montréal
- University of British Columbia-BC Cancer Agency
- Institut européen de bio-informatique
- CNRS – Université de Lyon
- Académie slovaque des sciences
- Université d’état à Sao Paulo
- Université de Zurich
- Institut de recherche médicale Hauptman Woodward
- Centro di Riferimento Oncologico (CRO)
- IBM
- Lenovo
Information additionnelle
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Titre |
Hyperlien |
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La communauté mondiale du grid d’IBM |
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Integrated Interactions Database |
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pathDIP |
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mirDIP: microRNA Data Integration Portal |
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FpClass - interactions and properties of human proteins |
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NetwoRx: Connecting Drugs to Networks and Phenotypes |