Plateforme de bioinformatique d’Ottawa

Université d'Ottawa, Ottawa, Ontario
Que fait l'installation

Bioinformatique, analyse de données et conception expérimentale

Domaines d'expertise

Nous offrons des conseils sur les méthodologies de recherche en bio‑informatique, effectuons des analyses de bio‑informatique et fournissons des services de soutien aux demandes de subvention se rapportant à la bio‑informatique, y compris la réalisation d’études pilotes, de lettres de soutien ou de collaboration et de textes méthodologiques.

En 2020, la Plateforme de bioinformatique d’Ottawa a endossé la paternité ou obtenu une reconnaissance à l’égard de onze ouvrages publiés, dont celui de Zagozewski, J. et coll., An OTX2‑PAX3 signaling axis regulates Group 3 medulloblastoma cell fate, Nature Communications 9 2020, et été citée en tête de deux thèses de maîtrise.

Services de recherche
  • Analyse de séquençage haut débit, dont le séquençage par immunoprécipitation de la chromatine (ChIP); le séquençage de cellule simple ou de masse par test pour la transposase accessible chromatine (ATAC) de cellule simple ou de masse; le séquençage d’ARN de cellule simple ou de masse; la méthode Hi-C et d’autres méthodes d’essai de conformation de la chromatine; la détection des variants de génome entier, d’exome et de panel sélectionné
  • Intégration de sources multiples de données, dont des données d’archives
  • Analyse de réseaux
  • Analyse de microréseaux
Secteurs d'application
  • Agriculture, alimentaire et sciences animales
  • Pêches et aquaculture
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
  • Industrie océanologique

Laboratoire spécialisé

Équipement

Fonction

Centre d’informatique évoluée de l’Université Queen’s (CAC)

 

Logiciel de serveurs en grappe Linux/SLURM

 

  • SLURM : Simple Linux Utility for Resource Management (utilitaire simple Linux de gestion des ressources)
  • Informatique, stockage de données, sauvegarde