Offre des services de métabolomique ciblée, quantitative et complète.
Le Centre d’innovation en métabolomique (TMIC) est une installation de recherche nord-américaine de premier plan, spécialisée dans la recherche avancée en métabolomique et en lipidomique. Il soutient des études cliniques, biomédicales, environnementales et agricoles. Plus précisément, le centre propose son expertise en profilage métabolomique ciblée et non ciblée, en quantification absolue et semi-relative, ainsi qu’en analyses métabolomiques à haut débit dans le cadre d’études de grande envergure.
Le centre est doté d’une infrastructure métabolomique de pointe capable de quantifier intégralement jusqu’à 2 000 espèces chimiques, y compris les sommes et les rapports calculés, soit une analyse environ 5 fois plus complète que celle offerte par la plupart des services du domaine. De plus, grâce à des technologies complémentaires, le centre peut identifier plus de 8 000 biomarqueurs potentiels dans un seul échantillon. Le centre possède une expertise en métabolomique et en lipidomique quantitatives effectuées à l’aide d'étalons isotopiques et de l’imagerie par spectrométrie de masse ainsi qu’en profilage métabolomique et lipidomique complet réalisé selon des stratégies novatrices de marquage isotopique chimique. Grâce à un large éventail de plateformes d’analyse, les équipes du Centre peuvent détecter, identifier et mesurer couramment différentes classes de métabolites et de voies métaboliques dans divers biofluides, matériel végétal, échantillons environnementaux et autres matrices d’échantillons.
Le centre héberge également des ressources bio-informatiques mondialement reconnues et librement accessibles, dont la base de données Human Metabolome Database et la plateforme MetaboAnalyst. En outre, le centre fournit un soutien spécialisé en matière d’analyse et d’interprétation de données. Enfin, l’expansion continue des installations de métabolomique clinique certifiées ISO renforce sa capacité de recherche réglementée, clinique et translationnelle.
Le centre offre des services de métabolomique et de lipidomique à une clientèle diversifiée, provenant des milieux universitaire, gouvernemental et industriel de différents secteurs, dont la santé humaine, l’agriculture et l’agroalimentaire, l’environnement, les ressources naturelles et la foresterie. Le profilage métabolomique est offert pour une grande variété d’échantillons, notamment le sérum et le plasma, l’urine, les tissus, la matière fécale, le matériel végétal, les aliments, la matière d’origine animale, les cellules et les extraits cellulaires, ainsi que de nombreuses autres matrices biologiques complexes.
Métabolomique et lipidomique quantitatives : ces services s’appuient sur un ensemble de plateformes de spectrométrie de masse et de résonance magnétique nucléaire pour effectuer l’analyse quantitative de centaines de métabolites, de lipides et de minéraux, avec des étalons marqués par des isotopes stables pour permettre une quantification absolue. Les équipes de recherche peuvent ainsi quantifier les changements dans les voies métaboliques principales, dont le cycle de l’acide citrique (cycle de Krebs), le métabolisme central du carbone, le métabolisme des acides gras et le métabolisme des acides aminés.
Métabolomique et lipidomique non ciblées : ces analyses s’effectuent à l’aide de la spectrométrie de masse à haute résolution et de la résonance magnétique nucléaire. Le centre utilise un large éventail de techniques de séparation et d’introduction des échantillons, ainsi que des stratégies novatrices de marquage isotopique chimique. En fonction du type d’échantillon, les analyses peuvent systématiquement détecter jusqu’à 10 000 caractéristiques et identifier de 7 000 à 10 000 métabolites. L’offre de services du centre comprend des analyses statistiques complètes.
Métabolomique globale : ce service combine une détection d’un large éventail de métabolites et une quantification relative précise au sein d’un flux de travail continu unique. Grâce au marquage isotopique chimique (CIL), la métabolomique globale assure une couverture étendue des métabolites tout en facilitant des comparaisons précises de quantification entre les échantillons. Cette méthode convient parfaitement aux études nécessitant à la fois une analyse exploratoire et un profilage comparatif des métabolites.
Analyse des données et bio-informatique : le centre offre en libre accès sur son site Web une gamme de ressources, dont des bases de données métabolomiques et des logiciels d’analyse de données.
Installations certifiées ISO : certains services en métabolomique sont fournis par des laboratoires certifiés ISO, dont une installation de recherche certifiée ISO 15189 à l’Université de l’Alberta et les laboratoires médicaux certifiés ISO 15189 situés à l’Institut Lady Davis de l’Hôpital général juif de l’Université McGill.
- Agriculture, alimentaire et sciences animales
- Défense et industrie de la sécurité
- Technologies et services de l’environnement
- Pêches et aquaculture
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
- Analyse métabolomique par spectrométrie de masse à haute résolution : profilage métabolomique non ciblée et identification des métabolites, à l’aide de spectromètres de masse quadripolaire à temps de vol (Q-TOF), à temps de vol (TOF) et hybride quadripolaire-Orbitrap.
- Analyse métabolomique ciblée et quantitative : analyse à l’aide de spectromètres de masse quadripolaire en tandem, à piège ionique et QTRAP pour quantifier avec précision des métabolites.
- Plateformes de chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (CL-SM) : systèmes de chromatographie liquide à ultra-haute pression et à haute performance couplés à des spectromètres de masse pour la séparation et l’analyse de biofluides complexes et d’échantillons biologiques.
- Chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (CG-SM) : analyse des composés volatils et semi-volatils, à l’aide de la chromatographie en phase gazeuse unidimensionnelle et bidimensionnelle (CG×CG) couplée à la détection à ionisation de flamme et à la spectrométrie de masse à temps de vol.
- Spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) : spectroscopie RMN à champ magnétique élevé (600–700 MHz) pour l’identification et la quantification de métabolites hydrosolubles.
- Séparation par électrophorèse capillaire : séparation à haute performance de petites molécules, à l’aide de l’électrophorèse capillaire couplée à la détection par ultraviolets ou à la spectrométrie de masse à temps de vol pour la métabolomique ciblée et non ciblée.
- Analyse élémentaire et analyse des métaux : analyse à l’aide de la spectrométrie de masse à plasma à couplage inductif (ICP-MS) pour déterminer la teneur en métaux et en minéraux.
- Spectrométrie de masse MALDI : Spectrométrie de masse à temps de vol avec désorption et ionisation laser assistée par matrice (MALDI) pour une analyse métabolomique rapide et à haute résolution.
- Préparation automatisée des échantillons et flux de travail à haut débit : systèmes robotisés de manipulation des liquides et de préparation automatisée des échantillons pour mener des analyses métabolomiques à haut débit.
Partenaires de recherche des secteurs privé et public
- Université de l’Alberta
- Université de Victoria
- Université de la Colombie-Britannique
- Université McMaster
- Université McGill/Institut Lady Davis de recherches médicales de l’Hôpital général juif de Montréal
- Université Concordia