Profilage de métabolites ciblés et non ciblés par spectrométrie de masse, analyse personnalisée de molécules de petite taille et technologies de respiration cellulaire in vivo (Seahorse).
La Plateforme de métabolomique de l’Institut du cancer Rosalind et Morris Goodman a pour mission de travailler en collaboration, en tenant lieu de prolongement du laboratoire de chaque utilisateur et utilisatrice. On y planifie, conçoit et réalise des études, et l’on y forme des chercheurs et chercheuses à nos technologies. Nous nous spécialisons en couverture d'une large gamme de métabolites centraux du carbone, y compris les métabolites instables. Nos méthodes éprouvées peuvent servir à l'analyse de traceurs isotopiques stables pour nous aider à comprendre comment les voies métaboliques sont utilisées dans diverses conditions nutritives.
La Plateforme de métabolomique emploie du personnel spécialisé en chimie analytique et en biochimie doté d’une expertise particulière en spectrométrie de masse des molécules de petite taille et en respiration cellulaire.
Il compte actuellement six spectromètres de masse et trois systèmes « Seahorse », qui servent au profilage des métabolites et aux projets personnalisés selon les besoins de la clientèle.
- Métabolisme central du carbone (>260 métabolites)
- Amines biogènes (>100 métabolites)
- Acides gras libres (acides gras non estérifiés)
- Esters méthyliques d'acides gras (acides gras issus de lipides complexes)
- Stéroïdes
- Acides organiques (y compris les intermédiaires du cycle de l'acide tricarboxylique)
- Acides aminés et dérivés
- Métabolites instables
- Analyse des traceurs isotopiques stables pour toutes les méthodes ciblées
- Analyse non ciblée : fermentomique, métabolomique, lipidomique
- Conception de méthodes et de technologies sur mesure
- Agriculture, alimentaire et sciences animales
- Éducation
- Pêches et aquaculture
- Foresterie et industrie forestière
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
| Équipement | Fonction |
|---|---|
| Système de spectrométrie de masse 6470 UHPLC-QQQ de Agilent | Chromatographie liquide ultra performante couplée à la spectrométrie de masse triple quadripolaire : méthode d’analyse des métabolites ciblés axée sur l'appariement des ions. |
| Système de spectrométrie de masse 6430 UHPLC-QQQ de Agilent | Chromatographie liquide ultra performante couplée à la spectrométrie de masse triple quadripolaire : analyse des metabolites ciblés. |
| Système de spectrométrie de masse 6530 UHPLC-QTOF de Agilent | Chromatographie liquide ultra performante couplée à la spectrométrie de masse quadripolaire à temps de vol haute résolution : méthode d'analyse des traceurs isotopiques stables et des métabolites non ciblés axée sur l'appariement des ions. |
| Système de spectrométrie de masse 6545 UHPLC-QTOF de Agilent | Chromatographie liquide ultra performante couplée à la spectrométrie de masse quadripolaire à temps de vol haute résolution : analyse des traceurs isotopiques stables, analyse des métabolites non ciblés et analyse lipidomique. |
| Système de spectrométrie de masse 5977C GC/MSD de Agilent | Chromatographie en phase gazeuse avec spectrométrie de masse : analyse des acides organiques, des acides gras, des esters méthyliques d'acides gras, des traceurs isotopiques stables et autres métabolites. |
| Système de spectrométrie de masse 5975C GC/MSD de Agilent | Chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse : analyse des acides organiques, des acides gras, des esters méthyliques d'acides gras, des traceurs isotopiques stables et autres métabolites. |
| Système de chromatographie à fluide supercritique (SFC), modèle 1260 Infinity II de Agilent | Chromatographie liquide ultra performante, chromatographie à fluide supercritique. Séparation des lipides et des molécules chirales. |
| Analyseur Seahorse XFe96 de Agilent | Respiration cellulaire : plateforme à 96 puits. |
| Analyseur Seahorse XFe24 de Agilent | Respiration cellulaire : plateforme à 24 puits. |
| Analyseur Seahorse XFp de Agilent | Respiration cellulaire : plateforme à 6 puits. |
Information additionnelle
| Titre | Hyperlien |
|---|---|
| Page Google Scholar de la Plateforme de métabolomique. | https://scholar.google.ca/citations?hl=en&user=AU2v8P8AAAAJ&sortby=pubdate&view_op=list_works&gmla=… |
| Cibler les vulnérabilités métaboliques dans les projets de lutte contre le cancer : Exploiter les faiblesses métaboliques du cancer du sein pour mettre au point de nouveaux traitements pour les femmes atteintes d'une maladie métastatique et résistante aux médicaments. | https://www.tfri.ca/our-research/research-project/targeting-metabolic-vulnerabilities-in-cancer |
| Tuer les cellules cancéreuses en les empêchant d’utiliser l’oxygène et le sucre. | https://cancer.ca/fr/research/for-researchers/funding-results/breakthrough-team-grants/killing-canc… |