Laboratoire d’ingénierie des protéines

Université du Québec - Institut national de la recherche scientifique (INRS), Laval, Québec
Que fait l'installation

Ingénierie et caractérisation moléculaire de protéines et de biocatalyseurs enzymatiques

Domaines d'expertise

Nos travaux de recherche ont pour principal objectif de modifier des biocatalyseurs enzymatiques destinés aux secteurs de l'environnement et des produits pharmaceutiques; ils visent à obtenir une meilleure compréhension du rôle entre la structure, la fonction et la flexibilité des enzymes de systèmes enzymatiques. Notre stratégie de recherche combine l'évolution dirigée d'enzymes et des expériences de mutagenèse semi-aléatoire, ainsi que la caractérisation biochimique et biophysique à l’aide, notamment, des techniques de résonance magnétique nucléaire (RMN), de biologie moléculaire, de cinétique enzymatique et de modélisation moléculaire. Grâce à cette approche combinée, nous cherchons à répondre aux objectifs suivants :

1 - Comprendre l'incidence de la séquence primaire et l'environnement structural des acides aminés conservés sur la dynamique enzymatique et les propriétés fonctionnelles des enzymes.

2 - Évaluer l'importance de la conservation des propriétés dynamiques spécifiques chez divers homologues enzymatiques structuraux et fonctionnels.

3 - Modifier, reproduire et appliquer les informations du rôle « structure-fonction » et « flexibilité-fonction » des enzymes à la création et à l’amélioration de biocatalyseurs moléculaires.

Nous avons participé à de multiples partenariats universités-entreprises. Nous développons de nouvelles technologies visant l’utilisation d’enzymes à des fins de chimie verte et de biocatalyse industrielle. Notre infrastructure permet la modification, l’amélioration, la production et la caractérisation d’enzymes à fort potentiel industriel.

Services de recherche
  • Biologie moléculaire
  • Expression
  • Purification
  • Caractérisation d’enzymes
Secteurs d'application
  • Agriculture, alimentaire et sciences animales
  • Industrie chimique
  • Technologies et services de l’environnement
  • Foresterie et industrie forestière
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
  • Fabrication et transformation

Équipement

Fonction

Calorimètre à titrage isotherme (ITC)

Calcul des interactions protéine-protéine et protéine-ligands

Spectropolarimètre à dichroïsme circulaire (CD)

Estimation de la structure des protéines et des paramètres de dénaturation

Spectrophotomètre UV-Visible

Cinétique enzymatique

Fluorimètre

Cinétique enzymatique

Spectrophotomètre NanoDrop

Dosage et cinétique de microvolumes

Électroporateur

Transformation d’ADN chez les bactéries

Agitateur-incubateur réfrigéré

Culture bactérienne

Agitateur-incubateur

Culture bactérienne

Sonicateur

Lyse cellulaire bactérienne

Centrifugeuse de table réfrigérée

Centrifugation

Microcentrifugeuse réfrigérée

Centrifugation

Centrifugeuse Avanti

Centrifugation

Concentrateurs stirred-cell

Concentration de volumes

Thermocycleur

Amplification PCR d’ADN

Réfrigérateur -80C

Conservation de cultures bactériennes

pH-mètres

Mesure de pH

FPLC/HPLC

Chromatographie liquide à faible et haute pression, séparation de composés, purification de protéines

Lectrice à plaques

Mesure de spectrophotométrie et de fluorimétrie à haut débit

Balances analytiques

 

Titre

Hyperlien

Isolement et caractérisation de l’EstC, une nouvelle estérase active à froid de Streptomyces coelicolor A3(2)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22396747

Conservation de groupes de résidus flexibles parmi les homologues enzymatiques structuraux et fonctionnels

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23135272

Le laboratoire Doucet

http://www.profs.inrs.ca/ndoucet/