Ingénierie et caractérisation moléculaire de protéines et de biocatalyseurs enzymatiques
Nos travaux de recherche ont pour principal objectif de modifier des biocatalyseurs enzymatiques destinés aux secteurs de l'environnement et des produits pharmaceutiques; ils visent à obtenir une meilleure compréhension du rôle entre la structure, la fonction et la flexibilité des enzymes de systèmes enzymatiques. Notre stratégie de recherche combine l'évolution dirigée d'enzymes et des expériences de mutagenèse semi-aléatoire, ainsi que la caractérisation biochimique et biophysique à l’aide, notamment, des techniques de résonance magnétique nucléaire (RMN), de biologie moléculaire, de cinétique enzymatique et de modélisation moléculaire. Grâce à cette approche combinée, nous cherchons à répondre aux objectifs suivants :
1 - Comprendre l'incidence de la séquence primaire et l'environnement structural des acides aminés conservés sur la dynamique enzymatique et les propriétés fonctionnelles des enzymes.
2 - Évaluer l'importance de la conservation des propriétés dynamiques spécifiques chez divers homologues enzymatiques structuraux et fonctionnels.
3 - Modifier, reproduire et appliquer les informations du rôle « structure-fonction » et « flexibilité-fonction » des enzymes à la création et à l’amélioration de biocatalyseurs moléculaires.
Nous avons participé à de multiples partenariats universités-entreprises. Nous développons de nouvelles technologies visant l’utilisation d’enzymes à des fins de chimie verte et de biocatalyse industrielle. Notre infrastructure permet la modification, l’amélioration, la production et la caractérisation d’enzymes à fort potentiel industriel.
- Biologie moléculaire
- Expression
- Purification
- Caractérisation d’enzymes
- Agriculture, alimentaire et sciences animales
- Industrie chimique
- Technologies et services de l’environnement
- Foresterie et industrie forestière
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
- Fabrication et transformation
Laboratoires et équipements spécialisés
Équipement |
Fonction |
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Calorimètre à titrage isotherme (ITC) |
Calcul des interactions protéine-protéine et protéine-ligands |
Spectropolarimètre à dichroïsme circulaire (CD) |
Estimation de la structure des protéines et des paramètres de dénaturation |
Spectrophotomètre UV-Visible |
Cinétique enzymatique |
Fluorimètre |
Cinétique enzymatique |
Spectrophotomètre NanoDrop |
Dosage et cinétique de microvolumes |
Électroporateur |
Transformation d’ADN chez les bactéries |
Agitateur-incubateur réfrigéré |
Culture bactérienne |
Agitateur-incubateur |
Culture bactérienne |
Sonicateur |
Lyse cellulaire bactérienne |
Centrifugeuse de table réfrigérée |
Centrifugation |
Microcentrifugeuse réfrigérée |
Centrifugation |
Centrifugeuse Avanti |
Centrifugation |
Concentrateurs stirred-cell |
Concentration de volumes |
Thermocycleur |
Amplification PCR d’ADN |
Réfrigérateur -80C |
Conservation de cultures bactériennes |
pH-mètres |
Mesure de pH |
FPLC/HPLC |
Chromatographie liquide à faible et haute pression, séparation de composés, purification de protéines |
Lectrice à plaques |
Mesure de spectrophotométrie et de fluorimétrie à haut débit |
Balances analytiques |
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Information additionnelle
Titre |
Hyperlien |
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Isolement et caractérisation de l’EstC, une nouvelle estérase active à froid de Streptomyces coelicolor A3(2) |
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Conservation de groupes de résidus flexibles parmi les homologues enzymatiques structuraux et fonctionnels |
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Laboratoire de spectroscopie en résonance magnétique nucléaire (RMN) | https://inrs.ca/la-recherche/infrastructures-de-recherche/repertoire-des-infrastructures-de-recherc…; |
Nicolas Doucet |