Institut de recherche Krembil; Centre de découverte des sciences de la vie IBM; Laboratoire Jurisica

Réseau universitaire de santé, Toronto, Ontario
Que fait l'installation

Bio-informatique intégrative, analyse de données massives, exploration de données, apprentissage machine et visualisation de données.

Domaines d'expertise

La recherche au laboratoire Jurisica porte sur la bio-informatique intégrative ainsi que sur la représentation, l’analyse et la visualisation de données hautement dimensionnelles à la recherche de signatures pronostiques ou prévisionnelles, la détermination de thérapies d’association cliniquement pertinentes et la modélisation de mécanismes fidèles d’action médicamenteuse et de cascades de signalisation modifiées par la maladie.

Nous avons publié de nombreux articles sur l’exploration de données, la visualisation et l’oncologie informatique dans des revues telles Science, Nature, Nature Medicine, Nature Methods, J Clinical Oncology, dont 623 citations hautement influentes (SemanticScholar). Nous avons été cités plus de 14 389 fois (SCOPUS). Le laboratoire Jurisica figure sur les listes de classement des chercheurs les plus cités de Thomson Reuters de 2014, 2015 et 2016, de même que dans les rapports 2014 et 2015 sur les esprits scientifiques les plus influents du monde. Depuis 2015, il agit également à titre de scientifique en chef au laboratoire de destruction créative de la Rotman School of Management.

Services de recherche

Analyses de données évolutives, visualisation, annotation et interprétation de données complexes, exploration de données et apprentissage machine, modélisation de mécanismes fidèles d’action médicamenteuse et de cascades de signalisation modifiées par la maladie, recherche de signatures pronostiques fondée sur l’exploration de données.

Secteurs d'application
  • Technologies de l’information et des communications, et médias
  • Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical

Nom du laboratoire spécialisé 

Nom de l’équipement

Résumé de la fonction

Centre de découverte des sciences de la vie IBM

Serveurs, grappes et stockage

384 cœurs en serveurs pSeries IBM (2X p770, p780, p750, 2x p570, p595), grappe de GPU avec 84 cartes Nvidia K20, grappe de 1344 cœurs Linux et plus de 1,6 Po d’espace disque hiérarchique avec bibliothèque d’archives robotisées LTO4 pour l’archivage prolongé des données.

La communauté mondiale du grid d’IBM

http://www.worldcommunitygrid.org/index.jsp?language=fr_CA

Accès aux ressources de calcul de haute performance de Calcul Canada

  • University of Toronto
  • McMaster University
  • York University
  • Queen’s University
  • Université de Montréal
  • University of British Columbia-BC Cancer Agency
  • Institut européen de bio-informatique
  • CNRS – Université de Lyon
  • Académie slovaque des sciences
  • Université d’état à Sao Paulo
  • Université de Zurich
  • Institut de recherche médicale Hauptman Woodward
  • Centro di Riferimento Oncologico (CRO)
  • IBM
  • Lenovo