Détection et quantification de l’ARN et de l’ADN présents dans des échantillons biologiques
La plateforme RNomique de l’Université de Sherbrooke offre un large éventail de services de séquençage de nouvelle génération, de PCR et de bio-informatique à toute la communauté de recherche. Notre plateforme automatisée de calcul et d’expérimentation a été conçue principalement pour du séquençage à grande échelle et des expériences reposant sur la PCR. Les principales applications sont l’étude comparative de l’expression génétique au moyen du séquençage de l’ARN et de la PCR quantitative, ainsi que l’annotation et l’analyse de l’épissage alternatif par PCR en point final couplée à l’électrophorèse microcapillaire (PCR allèle spécifique; ASPCR). De plus, nous préparons, exécutons et analysons sur une base quotidienne quelques milliers d’essais de PCR quantitative et d’ASPCR. Nous offrons aussi des services complémentaires d’isolation et de contrôle de la qualité de l’ARN et de l’ADN provenant de cultures cellulaires et de tissus, ainsi qu’un important soutien en bio-informatique pour les plans d’expérience et l’analyse de données. Les clients peuvent consulter leurs données et leurs résultats expérimentaux sur une application web sécurisée, qui contient d’ailleurs plusieurs modules informatiques permettant d’optimiser l’analyse et la présentation des données. Le personnel de la plateforme met son expertise à la disposition des clients à toute étape de leurs projets. La plateforme est par ailleurs en constante évolution : de nouveaux essais et protocoles bio-informatiques sont créés régulièrement pour répondre aux besoins de la clientèle grandissante.
Extraction de l’ARN et de l’ADN, contrôle de la qualité de l’ARN, séquençage de l’ARN, séquençage de nouvelle génération, essais de PCR personnalisés, PCR à haut débit, PCR quantitative, expression génétique, analyse de l’épissage alternatif, bio-informatique, exploration de données de séquences
- Agriculture, alimentaire et sciences animales
- Industrie chimique
- Technologies propres
- Défense et industrie de la sécurité
- Énergie
- Technologies et services de l’environnement
- Pêches et aquaculture
- Foresterie et industrie forestière
- Soins de santé et services sociaux
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
Équipement |
Fonction |
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Appareil de bioanalyse 2100 d’Agilent |
Détection microcapillaire, quantification et contrôle de la qualité de l’ARN et de l’ADN |
LC-90 de Caliper |
Quantification et détection microcapillaire de l’ADN à grande échelle (trois instruments) |
MiSeq d’Illumina |
Séquençage de nouvelle génération |
PGM (Personal Genome Machine) Ion Torrent |
Séquençage de nouvelle génération |
GS Junior de Roche |
Séquençage de nouvelle génération |
CFX384 de Bio-Rad |
PCR quantitative avec plaques de 384 puits (trois instruments) |
CFX96 de Bio-Rad |
PCR quantitative avec plaques de 96 puits (trois instruments) |
Applied Biosystems GeneAmp 9700 |
PCR en point final |
Biomek FX |
Manipulation de liquides |
GeXP Genetic Analysis de Beckman |
Électrophorèse capillaire |