Recherche sur la diversité génétique à l’aide de techniques expérimentales et de calcul offrant la possibilité de se servir d’ échantillons biologiques pour extraire l'ADN génomique et effectuer de la manipulation de base, ainsi que le séquençage et l'analyse d’ADN.
Grâce à une approche intégrée combinant des technologies de génomique fonctionnelle et comparative computationelles et expérimentales, le laboratoire se penche sur l’étude des mécanismes de la diversité génétique interspécifique et intraspécifique et sur leur contribution à la diversité des caractères biologiques et ce, dans l’optique particulière de réaliser des tests génétiques sur le génome entier (pureté génétique), actuellement axés sur les levures de vigne et de vin, mais qui pourraient porter sur d'autres espèces.
Logiciels génomiques disponibles pour : 1) l’analyse de données de méthylation et de données cytogénétiques, la prédiction des exons , l’identification des gènes; 2) l’accès aux bases de données : polymorphismes d'insertion de rétrotransposons, syndrome d'Hermansky-Pudlak, biologie cellulaire et moléculaire comparative de la longévité; 3) les tests génétiques basés sur le séquençage du génome entier (pour les levures de vigne et de vin); 4) l’analyse des profils d’éléments transposables des génomes.
- Agriculture, alimentaire et sciences animales
- Sciences de la vie, produits pharmaceutiques et équipement médical
Laboratoires et équipements spécialisés
| Équipement | Fonction |
|---|---|
| Logiciel FALCOR. | Calculer la fréquence et le taux de mutation à partir de divers essais de mutation chez les bactéries et les levures (test de fluctuation de Luria et Delbrück). |
| Logiciel Prot2Gene. | Effectuer avec précision la prédiction des exons et les cartographie à l’aide de séquences de protéines. |
| Base de données de polymorphismes d'insertion de rétrotransposons (dbRIP) | Stocker des données sur les polymorphismes d’insertion de rétrotransposons humains (RIP) intégrés dans les annotations des données du génome humain (navigateur de génome de l’Université de la Californie à Santa Cruz [UCSC]). |
Information additionnelle
| Titre | Hyperlien |
|---|---|
| Professeur Ping Liang. | https://brocku.ca/mathematics-science/biology/directory/ping-liang/ |
| Base de données dbRIP. | https://dbrip.brocku.ca |
| Logiciel FALCOR. | http://genomics.brocku.ca/FALCOR/ |
| Logiciel Prot2Gene. | http://genomics.brocku.ca/prot2gene/ |